CUT&Tag（全称Cleavage Under Targets and Tagmentation）是一种创新的DNA-蛋白质相互作用研究技术，专门用于全基因组范围内转录因子和组蛋白修饰的结合位点分析。该技术的核心原理在于利用抗体特异性识别目标蛋白或特定的染色质修饰标记，并通过蛋白酶Tn5转座酶实现高效的DNA片段化和文库构建。此技术是由Stephen Henikoff团队于2019年研发的，作为ChIP-Seq（染色质免疫共沉淀测序）的一种先进替代方法。

得益于其高灵敏度、低背景噪音和对细胞数量的低需求，CUT&Tag已成为揭示基因调控机制、解析染色质状态以及推动精准医学研究的重要工具。它广泛应用于表观遗传学研究、转录因子结合位点分析、疾病机制揭示、药物筛选与作用机制探索，以及单细胞基因调控研究等众多领域。

依托于先进的ProteinA/G-Tn5融合蛋白体系和高通量测序平台，百泰派克生物科技为科研人员提供专业的CUT&Tag技术服务，涵盖样本制备、文库构建、高通量测序及生物信息学分析的全过程。我们的技术团队拥有丰富的表观基因组学经验，能够高效、精准地解析蛋白质与DNA的相互作用，助力科研人员深入探讨基因调控的复杂机制。

技术背景

组蛋白通过形成核小体来压缩和保护DNA，其修饰（如乙酰化、甲基化）与DNA甲基化共同调控基因表达。这些修饰状态和动态变化对于细胞功能的维持至关重要，同时与多种疾病的发生和发展息息相关。因此，深入理解组蛋白与DNA之间复杂而精细的相互作用对于揭示正常生理过程和疾病状态，特别是癌症，具有重要的科学和临床价值。

CUT&Tag与ChIP-Seq技术比较

CUT&Tag的实现通过ProteinA/G-Tn5融合蛋白直接结合目标蛋白，省去了传统方法中交联步骤，从而显著降低背景噪音，并实现高分辨率的结合位点检测。CUT&Tag技术的流程包括几个关键步骤，首先使用ConA磁珠结合细胞膜上的糖蛋白以提取细胞核，然后通过透化细胞膜增强核膜的通透性，接着加入特异性抗体进行孵育并去除非特异性结合。随后，CUT&Tag通过激活Tn5酶实现DNA片段化并插入测序接头，最终利用Illumina平台进行高通量测序，与生物信息学工具组合进行数据分析，全面解析转录因子结合位点及染色质修饰的功能作用。

CUT&Tag技术特点

1. 低细胞量需求：仅需少量细胞（甚至单细胞）即可进行有效分析。

2. 高灵敏度：极低的背景噪声和较高的信噪比帮助提高结果的可靠性。

3. 高分辨率：能够精准定位转录因子与组蛋白修饰的结合区域。

4. 实验周期短：相较于传统ChIP-Seq，实验流程简化，耗时更少。

文献应用实例

CUT&Tag技术被用于揭示H3K18la在胰腺导管腺癌（PDAC）中的调控机制研究，为了解PDAC的生长与转移提供了重要线索。研究表明，组蛋白乳酸化水平的升高与PDAC患者的预后不良显著相关，而代谢重编程在此过程中起到了关键作用。

这一系列研究的结果突显了CUT&Tag的巨大潜力，不仅在于阐明具体基因转录调控机制，还能推动生物医药领域的更加深入的研究。依托这一技术，百泰派克生物科技致力于为客户提供全方位的技术支持，以助力疾病机制研究和新药开发的需要。

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